Komi-san wa, Comyushou desu.

Cerita berpusat kepada dua karakter utama, Komi Shouko dan Tadano Akira. Shouko atau biasa di panggil dengan Komi-san merupakan seorang siswi SMA cantik dan paling disegani oleh seluruh siswa Itan Private High School. Bagi siswa lain, Komi-san merupakan orang yang susah untuk didekati.

Walau begitu, hal ini tidak berlaku untuk Tadano Akira, seorang siswa SMA yang biasa-biasa saja. Tadano rupanya satu-satunya orang yang mengetahui fakta bahwa Komi-san memiliki masalah komunikasi dengan orang lain.

Untuk itu, Tadano mencoba membantu Komi-san berbicara dengan orang lain. Mampukah ia melakukannya?